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研究生科成立于2003年4月,2004年9月单独建立研究生党支部,2013年9月更名为研究生部,2017年按年级建立研究生50、51、52党支部,2020年6月19日更名为学科建设办公室。部门现有在职职工6人,其中博士1人,硕士2人,本科3人,设部长1人,副部长1人。学科建设办公室主要负责研究生思想政治教育、招生复试、就业、教学管理、学位管理、导师管理、研究生日常事务管理和学科建设等工作。我院1995年起开始硕士研究生招生培养工作,2011年临床医学获批成为一级学科硕士学位授权点,现有内科学、外科学、儿科学、影像医学与核医学、肿瘤学、临床检验诊断学、神经病学、老年病学、皮肤与性病学、妇产科学、耳鼻咽喉科学、眼病学、精神病与精神卫生学、麻醉学、康复医学与理疗学、运动医学、急诊医学、中西医结合临床、全科医学和临床病理学等20个专业招收硕士研究生。2021年,临床医学获批博士专业学位授权点,实现了我校博士点零的突破。2013年开展留学研究生教育,并入选国家教育部、国家卫生与计划生育委员会批准的第一批临床医学硕士专业学位研究生培养模式改革试点单位。同年,经四川省教育厅、卫生厅批准,我院率先在四川省开展"临床医学硕士专业学位研究生和住院医师规范化培养衔接"项目试点工作,实现硕士专业学位毕业证书、硕士学位证书、医师资格证书和住院医师规范化培训证书"四证合一";2015年,临床医学硕士专业学位研究生教育与住院医师规范化培训全面接轨,招收的临床医学专业学位研究生全部进入住院医师规范化培训;2016年临床医学成为四川省一流建设学科;2017年,临床医学院招收首批推荐免试生8人。2018年教育部第四轮学科评估结果公布,临床医学进入全国前70%,专业学位水平评估进入全国前75%。2019年,临床医学学位点顺利通过合格评估。1995年首次遴选6名硕士研究生导师;1996-2000年新增导师20人,2001-2005年新增导师46人,2006-2010年新增导师45人,2011-2015年新增导师56人,2016-2020年新增导师86人。2018年新增院内外特殊人才德国塔奇曼教授、张宗德博士为硕导。随着我院硕士研究生教育事业的迅速发展,2003年起学院先后与四川省人民医院、四川省肿瘤医院、中国人民解放军西部战区总医院等教学医院联合开展研究生教育,2020年新增深圳市人民医院等2所研究生教学基地。截止2021年3月,学院遴选了21批硕士研究生导师,目前硕士研究生导师总数549人(院内导师286+院外导师263人)。2001年开始联合培养博士生,先后与重庆医科大学、澳门科技大学、成都中医药大学、澳门大学、清迈大学、埃尔朗根-纽伦堡大学、波恩大学联合培养博士研究生。2001年首次遴选1名兼职博士研究生导师,先后共遴选兼职博士研究生导师28人次。2019年,我院与山东大学合作建立博士后工作站,遴选首批11名兼职博士后指导教师。2020年,我院与西安交通大学医学部联合培养同等学力博士项目西南班开班,是首家医院成为西安交通大学医学部研究生教学基地。2021年,我院与暨南大学联合培养临床医学博士项目正式启动。随着学院研究生教育的大力发展,招生人数迅速增加,从1995年招收1名、2000年25名、2005年162名、2010年233名、2015年362名,2020年招收558名,2021年招生606名,现有在校研究生1593名。27年来临床医学院共招收硕士研究生5234人,已毕业3808名硕士研究生。截止2020年1月,联合培养博士研究生27名。毕业的研究生主要服务于西部地区,辐射全国各级医院,受到各用人单位的广泛好评,多数已成为单位的专业技术骨干。2016年,临床医学获批四川省一流建设学科。2016年7月,临床医学学科首次进入ESI全球前1%,排名89.44%,排名持续上升,截止2021年1月,ESI排名50.90%。中国科技量值排行榜,2014年我院5个学科进入排行榜,2019年8个学科进入排行榜,2020年21个学科进入排行榜。复旦大学医院管理研究所西南区专科声誉榜中,2015年我院6个学科获提名,2020年12个学科获提名,核医学科连续6年荣登西南区第二名。

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