疾病预防控制办公室（以下简称疾控办，原称疫情办公室）成立于2009年7月1日，主要负责医院传染病疫情监测、上报及管理工作。2016年4月，经昆明市卫计委批准，更名为疾控办，同年8月结核病项目办归入疾控办。目前科室主要承担医院的传染病防治、疫情上报、昆明市定点医院肺结核"三位一体"防治工作、不明原因肺炎监测、流感监测等疾病预防控制工作。科室共8名人员，设科主任1名、副主任1名，其中硕士1名、本科3名、大专1名、中专2名。
