山西儿童医院药剂科分为门诊门药房、中药房、急诊药房、住院中心药房。现有主任药师1名，副主任药3名、主管药师16名，住院药师22名。山西儿童医院制剂室配制的儿童用药病毒灵冲剂、清降丸、肺炎冲剂，妇科良药妇宁冲剂，在山西省内享有声誉赢得一致好评。
