产前诊断中心成立于2006年，是重庆市首批产前诊断技术服务机构之一，是重庆市唯一全国出生缺陷防治人才培训项目省级基地。产前筛查、遗传咨询、医学影像、细胞遗传及分子遗传诊断等技术服务均处于重庆市领先水平。作为西南片区临床遗传病学及产前诊断转会诊中心之一，为区域内患者提供便捷的优生遗传咨询、出生缺陷咨询、遗传病诊断、产前诊断、自然流产的病因学诊断与治疗等服务。2021年行介入性产前诊断近4000例，诊断出胎儿核型异常300余例，致病性拷贝数变异140余例，单基因疾病40余例。
