药学部是为医院采购、调配、核发药品及计划性采购医疗器械、保障医疗设备正常运转的重要部门。同时，还承担着林芝市突发事件的药品、氧气应急保障任务，也是林芝市率先开展临床药学专科建设的科室。
目前，药学部现有干部职工 18 名，其中：药学专业人员 12 名、氧气房工作人员 3 名、医疗设备工程师 1名、其他 2 名。
