南京医科大学眼科医院系南京医科大学附属眼科医院、江苏省红十字眼科医院，隶属于南京医科大学第四临床医学院，三级甲等眼科医院、国家临床重点专科、国家药物临床试验机构，于2004年,在原中日友好南京眼科医院（江苏省人民医院眼科分院）基础上,由南京医科大学创建。 医院还是江苏省眼科医疗质量控制中心主委单位、南京市眼科医疗质量控制中心主委单位、南京市基层眼科医疗质量控制中心主委单位、江苏省基层特色科室(眼科)孵化中心、南京市基层特色科室(眼科)孵化中心、江苏省儿童青少年近视防控研究中心、江苏省眼科学和视觉科学工程研究中心等 医院现有面积25000平方米，拥有汉中路和六合两个院区，核定床位150张。现有职工300多人，其中副高职称以上47人，博士生导师9人，硕士生导师13人，是一所集医疗、教学、科研于一体，在国内外具有一定影响力的非营利性三甲眼科专科医院。